对于沙门氏菌检测基因组工具成为关键

纽约ITHACA - 世界食品供应将变得更加安全，因为食品行业转向高分辨率，全基因组测序 - 同时检测特定生物体的完整DNA。这种使测序无处不在的举措将导致始终如一地可靠地检测沙门氏菌。

由康奈尔大学和火星全球食品安全中心(GFSC)的研究人员共同撰写的一篇发表在“微生物学前沿”杂志上的论文阐明了突破。

“沙门氏菌是全球公共卫生和经济影响最大的食源性病原体。它是世界各地腹泻的主要原因之一，”食品安全教授兼康奈尔食品系统研究所教授Martin Wiedmann说。“沙门氏菌可能是轻微的，也可能导致死亡，因为它的严重程度取决于沙门氏菌的血清型[不同的变异] - 而这正是我们试图找到的。”

该论文描述了世界各地的食品工业应如何更频繁地使用分子方法来分类和表征沙门氏菌。本文将旧的亚型实践 - 一些可追溯到20世纪30年代的实践 - 与较新的全基因组测序进行了比较，这种方法可以分析更广泛，更完整的基因组区域。

Wiedmann说，通过这种技术，科学家可以更准确地识别特定的沙门氏菌菌株，并确定疾病爆发的起源和途径。

例如，7月初美国食品和药物管理局和联邦疾病控制和预防中心(CDC)使用该技术，因为他们开始调查猪耳狗和人类之间的可疑沙门氏菌链接 - 由于人们处理对待。根据疾病预防控制中心的数据，当时有13个州有45例沙门氏菌病例，其中有12人住院治疗。

“全基因组测序正迅速成为沙门氏菌亚型选择的首选方法，”该论文的主要作者，火星全球食品安全中心的高级研究科学家Silin Tang说。“食品经常通过日益复杂的供应链接触消费者，创造了许多食品安全可能受到损害的机会。最近的案例强调了加强食品行业中沙门氏菌控制措施的必要性，包括使用适当的亚型工具快速准确地跟踪污染源。 “

唐说，食品行业有机会创建生物信息学专业人才管道 - 利用软件工具来理解生物数据 - 利用全基因组测序技术的全部潜力。

此外，Wiedmann说，本文将学术分析转化为有用的行业应用。“这将有助于工业实施更好的方法来主动解决沙门氏菌的并发症和复杂性，”他说。

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