用于细胞追踪创建的视频数据库

卡洛斯三世大学(UC3M)、格雷戈里奥的马拉农大学医院(HGUGM)和纳瓦拉大学与其他国际机构一起开发了一个用于细胞跟踪的视频数据库，可用于确定癌症等疾病的变化。

这项研究的结果最近发表在科学杂志《自然方法》上，该杂志收集了最近三次细胞追踪挑战的数据。比赛邀请了来自世界各地的科学家参与关于细胞迁移的视频，来自18个国家的21个研究小组参加了比赛。总共分析了52个92 GB的视频。有些是合成的，即由模拟细胞的软件创建，有些是真实的，主要是通过二维和三维显微镜获得。“除了视频，这个新数据库还提供了解释它们的代码，即分割算法和细胞跟踪，以及以客观方式评估这些算法的工具，”该研究的一位作者解释道。

在个体的一生中，尤其是胚胎发育期间，大量细胞增殖，如果有必要，它们会分化。这些细胞必须迁移到人体的不同部位才能发挥其功能。当细胞离开原发肿瘤产生转移并定居在其他组织时，这发生在正常过程(例如，红细胞迁移)和其他异常过程(例如，癌症)中。“通过研究细胞的运动和增殖，我们可以知道生命体如何在与癌症等疾病相关的正常过程和变化中发挥作用，”该研究的主要作者、纳瓦拉大学应用医学研究中心的实验室主任和模拟研究主任Carlos OrtizdeSolrzano解释说。“细胞追踪也是一种非常有用的工具，可以找到它的谱系，即器官细胞的来源，这样我们就可以研究疾病的初始过程，”他补充道。

为了了解细胞迁移如何改变癌症或其他疾病，或者转移是如何起源的，“通常需要以个体的方式识别细胞，并随着时间的推移跟踪它们，”arratemuozbarrutia解释道。这项研究发表在《自然方法》杂志上，对于在研究中使用细胞追踪方法的研究人员来说非常有用。细胞追踪挑战中使用的所有材料都可以作为指南，帮助决定在不同情况下使用哪种算法解决方案，从而获得更准确的信息，更有助于提高生物医学领域的知识。“例如，我们已经证实，最有效的算法是那些使用学习技术的算法和那些考虑到细胞生命整体跟踪的算法，”Carlos OrtizdeSolrzano指出。

根据研究人员的说法，这种方法的应用有无穷无尽的用途。例如，它可以应用于研究胚胎发育、不同器官的形成机制以及对不同疾病(如癌症)治疗的反应。“肿瘤细胞的特征之一是更强的流动性和细胞增殖能力。基于对单个细胞的描述和随时间的跟踪，这两个方面可以以非常准确的方式量化，”穆尼奥斯-巴鲁蒂亚肯定地说。

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