模型可以帮助艾滋病毒结构研究

一个由多个机构组成的团队进行的研究(包括来自特拉华大学的两名成员)揭示了有关HIV衣壳结构及其发展方式的新细节。衣壳是一种蛋白质壳，包裹着病毒的遗传蓝图。

这项由康奈尔大学科学家领导的研究于8月1日发表在《自然》杂志上，重点研究了天然存在的称为IP6的小分子的作用。研究人员发现IP6在HIV生命周期的未成熟阶段和成熟阶段都起着重要的作用。

康奈尔大学的博士后研究员，论文的第一作者罗伯特·迪克说：“这个小分子在通路中的两个不同组装步骤中起作用。”“一个细胞可以产生数百万个病毒颗粒，但是如果它们不经过成熟过程，就不会具有传染性。”

UD化学和生物化学助理教授Juan R. Perilla说，发现IP6所起的关键作用“为针对该分子的新疗法的开发打开了一扇门”。

该论文的合著者Perilla和UD博士生徐超一，对该研究项目进行了计算和分析工作，使用超级计算机对HIV衣壳和IP6在其组装中的作用进行了建模。

“许多实验技术只是一个快照，” Perilla说。“借助计算显微镜(将实验室数据与超级计算机结合使用)，您实际上可以看到事物的运动方式。”

Perilla和Xu通过国家科学基金会资助的极限科学与工程环境(XSEDE)项目进行了仿真，该项目将超级计算机资源分配给特定的研究问题。他们使用的计算机分别位于匹兹堡超级计算中心和德克萨斯高级计算中心。

佩雷利亚在UD的研究团队对HIV的其他方面和乙型肝炎病毒进行了类似类型的模拟和分析。研究人员还研究了除HIV外的其他逆转录病毒，包括马和家禽病毒。

“就像我们发现艾滋病病毒利用IP6来发展并具有传染性一样，我们想了解一般如何'学习'逆转录病毒来使用这类分子，” Perilla说。病毒总是在进化，但是这种特殊的机制尤其重要。

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