人类肠道内发现近2000种未知细菌

来自EMBL欧洲生物信息学研究所和威康桑格研究所的研究人员已经发现了近2000种生活在人体内的细菌。这些物种没有在实验室培育过。该团队使用了一系列计算方法来分析世界各地的个人样本。

发表在《自然》杂志上的研究结果强调，尽管研究人员可能越来越接近创建北美和欧洲肠道中常见微生物的综合列表，但世界其他地区的数据非常匮乏。

人类肠道是许多微生物的家园，统称为肠道微生物群。尽管在这一领域进行了广泛的研究，但研究人员仍然试图识别生活在我们肠道中的单个微生物物种，并了解它们在人类健康中的作用。

重组细菌

作为肠道微生物群一部分的某些微生物物种长期不为人知的原因有很多，比如肠道丰度低或者无法在肠道外生存。使用计算方法，研究人员可以重建这些细菌的基因组。

“计算方法使我们能够了解我们尚未在实验室培养的细菌。使用宏基因组学来重建细菌基因组有点像将所有碎片混合在一起后重建数百个拼图，而不知道最终的图像会是什么样子。EMBL-EBI集团的负责人罗布芬恩说，从混合物中完全去除一些碎片后，只是让它变得更难一点研究人员现在处于这样一个阶段，他们可以使用一系列计算工具来补充有时指导实验室工作，以便发现对人类肠道的新见解。"

地理多样性

这项研究强调了世界各地肠道细菌的组成是如何不同的，以及我们的样本反映这种多样性的重要性。

“我们看到大量相同的细菌物种出现在欧洲和北美的人口数据中，”芬恩继续说道。“然而，我们在这项研究中获得的几个南美和非洲数据集显示，前者人群中没有显著的多样性。这表明，如果我们想真正全面地了解其构成，从代表性不足的人口中收集数据是必不可少的。人类的内脏。”

人类肠道的蓝图

“计算方法使我们能够了解生活在人类肠道中的许多细菌物种，它们是如何进化的，以及它们在微生物群落中可能扮演的角色，”EMBL-EBI大学的博士后研究员Alexandre Almeida说。胡桑格研究所。“在这项研究中，我们使用最全面的胃肠道细菌公共数据库来识别以前从未见过的细菌物种。我们使用的分析方法具有很高的可重复性，未来可以应用于更大、更多样化的数据集，从而进一步实现发现。”

“这样的研究正在帮助我们创建一个所谓的人类肠道蓝图，它可以帮助我们在未来更好地了解人类的健康和疾病，甚至指导胃肠道疾病的诊断和治疗，”该小组负责人特雷弗劳利总结道。在惠康桑格研究所。

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