绘制野生长颈鹿社会网络中抗抗生素大肠杆菌的传播图
明尼苏达大学的一个研究小组已经证明,野生长颈鹿体内的耐抗生素大肠杆菌最有可能来自人类,如当地的牛和人类。这项研究发表在《应用和环境微生物学》上。
“我们发现,在长颈鹿体内鉴定出的大肠杆菌的大部分抗生素耐药基因,此前已经鉴定出来自东非人类和牲畜的大肠杆菌,”通讯作者伊丽莎白米勒博士说,她是明尼苏达大学圣保罗兽医学院的博士后研究员。她说,很少有证据表明这些细菌是通过社会互动在长颈鹿中传播的。
令人惊讶的是,三个月或更小的长颈鹿比其他年龄组更容易携带抗生素耐药性大肠杆菌。米勒博士说:“这尤其令人惊讶,因为长颈鹿新生儿受到来自母亲的特殊照顾,与其他群体成员的互动极少,这使我们预测它们接触环境中耐药细菌和残留抗生素的比率非常低。”“这些结果表明,长颈鹿新生儿的肠道中可能存在抗生素耐药和易感大肠杆菌菌株之间的竞争,耐药大肠杆菌具有选择优势。
米勒博士说,为什么抗抗生素大肠杆菌优于敏感菌株,这是一个纯粹的推测性问题。“一个有趣的理论是指铁被收集的基因,发现它们与抗性基因出现在同一个质粒上,”她说。“具有这些额外铁获得基因的细菌可能在这种缺铁环境中具有选择优势,任何与铁抗性基因相关的抗生素抗性基因都将被携带,”她说,并指出这一理论此前在2004年该杂志的一篇文章中提出。
米勒博士表示,这项研究有助于科学理解抗性基因在自然生态系统中是如何传播的。“这项研究还强调了宿主年龄作为携带抗生素抗性细菌的预测因素的潜在重要性——至少在长颈鹿中是如此。此外,在新生长颈鹿中更频繁地发现耐药大肠杆菌的事实表明,新生肠道可能代表了微生物成员之间复杂的竞争动态场所。据我们所知,在人类和一些家畜中也观察到了类似的年龄相关模式,尤其是牛。这项研究首次在野生哺乳动物中展示了这种惊人的模式。”
合著者金伯利范德瓦尔当时是一名医生。加州大学戴维斯分校的一名学生在肯尼亚的一个野生动物保护区进行了她的研究的第一部分,该研究将商业牧场与野生动物保护结合起来,作为她博士学位的一部分。论文。她通过研究工具进行行为观察,以确定自然保护区内社会群体成员和长颈鹿的活动。当时,她关注的是社会互动如何影响疾病的传播。虽然这项研究很新颖,并产生了许多论文和学位论文,但它激发了米勒博士对狒狒进行类似的研究,因为她获得了博士学位。论文。
在获得博士学位后,范德瓦尔博士成为了明尼苏达大学兽医学院兽医种群医学系的助理教授,并为她带来了在肯尼亚收集的大肠杆菌冷冻样本。当米勒博士发现范德瓦尔博士正在寻找博士后研究员时,她立即提出了申请。
一旦安装在明尼苏达大学,米勒博士就使用标准抗生素敏感性测试来测试范德瓦尔博士的大肠杆菌对六种抗生素的耐药性,并使用全基因组测序来确定可能导致观察到的耐药表型的耐药基因。然后,她对范德瓦尔斯博士收集的数据进行了社交网络分析,以研究这些抗性基因是如何在长颈鹿中传播的。
“值得注意的是,我们真的不知道——如果有的话——野生动物中临床耐药细菌的风险是人类和牲畜的风险,”米勒博士说。“虽然理论上这些耐药细菌可能会传播给人类,因为它们可能来自人类和/或牲畜,但对我们的风险可能很小。然而,为了充分了解抗生素耐药性如何在局部和全球范围内产生,我们需要了解所有抗生素耐药性储存库及其潜在的传播动态。”
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