首页 >> 国外研究 >

先进的计算机技术和软件使物种鉴定具有互动性

2022-07-15 11:40:06 来源: 用户: 

一批成功的生物防治剂被用于果蝇的各种害虫,而寄生蜂仍然在很大程度上被忽视。虽然它的最新识别键可以追溯到1969年,但从那以后又增加了许多新物种。似乎更糟糕的是,这组视觉上相同的物种很可能包含许多尚未被描述为新科学物种的物种。

瑞士伯尔尼自然历史博物馆的科学家法比安克里默克(Fabian Klimmek)和汉尼斯鲍尔(Andrew Baur)最近对中欧这些黄蜂的物种群进行了研究,不仅论证了知识更新的必要性,也展示了现代分类学软件进行分析的优势。大量的描述性和定量数据。

该团队的分类学论文发表在开放获取生物多样性数据期刊上,描述了一个新物种——ptero Malus capito——并讨论了Pierre-and-Marie的信息学和系统学实验室开发的Xper3,供免费使用。——居里大学。该软件用于创建一个可公开获取的物种群Pteromalus albipennis的更新密钥。

图示的交互式数据库涵盖了本组27个物种和18个相关物种,此外还有完整的诊断、大量的物理测量和总共585幅图像,显示了每个物种的大部分特征。

“如今,先进的计算机技术、测量程序和设备允许更复杂的方法包括定量特征,这大大增强了对隐藏物种的划界,”这位科学家解释说。

“最近开发的用于创建生物特征密钥的软件,如Xper3、Lucid或Delta,可能会取代传统的纸质密钥。”

为了把这种说法放在上下文中,作者举了一个研究黄蜂种类的例子。如果使用先前可用的识别密钥,其识别将需要16个步骤,而交互式替代方案仅需要6个步骤。

Xper3之类的工具之所以如此快速高效,其中一个原因是,key的作者可以将所有的描述性字符按照特定的顺序列出,并在物种划界中赋予不同的权重。因此,每当昆虫学家试图识别黄蜂标本时,该软件将首先检查顶部的描述符,以便它可以排除不匹配的分类,并提供剩余名称的列表。每当剩下一个以上的名字时,将在列表的底部进行检查,直到剩下一个,该名字应该是与样本相对应的那个。在任何时候,研究人员都可以访问年表来检查是否有任何潜在的错配,而不会中断这个过程。

作为数字可用软件的产品,交互式识别密钥不仅发布简单、快速且廉价,而且易于以协作方式编辑和构建。全世界的专家都可以更新密钥,只要作者授予他们特定的用户权限。然而,无论数据库更新多少次,一个永久的URL链接将总是提供对最新版本的访问。

科学家在OpenAIRE和CERN创建的研究数据Zenodo中存储所有原始数据文件、R脚本、照片、文件列表和准备好的样本。

  免责声明:本文由用户上传,与本网站立场无关。财经信息仅供读者参考,并不构成投资建议。投资者据此操作,风险自担。 如有侵权请联系删除!

 
分享:
最新文章