一种新的快速稳定的单细胞分析方法

我们身体中的许多细胞类型以模糊的方式工作，科学还没有完全理解它们。这也适用于免疫细胞，免疫细胞是保护我们免受严重疾病的关键。

为了克服这一障碍，研究人员做出了大量努力，寻找新的方法来研究单个细胞的内部工作。

“挑战不仅仅是从组织样本中分离出单个细胞。我们还需要找到一种方法来确定单个细胞的功能，”生物化学和分子生物学系助理教授兼首席研究员Kedar Nath Natarajan说。南丹麦大学。

在威康桑格研究所的凯达纳特纳塔拉詹和陈曦领导的一项新研究中，一个研究小组开发了一种对器官和组织中微小单细胞进行显微分析的新方法。

这种新方法可以分析来自脾脏的3000多个细胞，脾脏是各种免疫细胞的热点。细胞可以抵抗感染，但也可以提供日常免疫和反应。

不断开发新的方法，用显微镜观察器官和组织中微小的单细胞。原理是研究生研究对象的基本蓝图，即DNA以及如何将其包装在单个细胞中。这个包被称为染色质，并指示蓝图中哪些基因被开启和关闭，从而决定它是否成为血细胞、皮肤细胞、免疫细胞、癌细胞或其他类型的细胞。

“我们的新方法描述了单细胞中的染色质，为现有技术提供了一种强大、可扩展和更便宜的替代方法，现有技术需要昂贵的基础设施、特殊试剂和设备，”Kedar Nath Natarajan说。

他与惠康桑格研究所的第一作者陈曦一起，领导了新方法的开发，并引入了各种细胞，包括免疫细胞、干细胞等。威康桑格研究所的其他贡献者是Ricardo J Miragaia，这项工作已经在通讯员Sarah A Teichmann的实验室中完成。

论文摘要给出了这样的描述：

测序(ATAC-序列)被广泛用于通过测量转座酶可及的染色质来鉴定整个基因组中的调控区域。然而，由于技术挑战，在单细胞水平(scATAC-seq)的研究很少。在这里，我们开发了一个简单而强大的基于board的scATACseq方法，将前端批量Tn5标记与单核排序相结合。我们证明了我们的方法在各种系统中稳定工作，包括来自原代组织的新鲜和冷冻保存的细胞。通过分析3000多个脾细胞，我们鉴定了不同的免疫细胞类型，并揭示了细胞类型特异性调控区域和相关转录因子。

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