在癌症基因组未开发区域发现新的肿瘤驱动突变

多伦多-(2020年1月17日)在一项前所未有的全基因组癌症分析中，来自安大略省癌症研究所(OICR)的研究人员发现了非编码DNA的新区域，一旦改变，可能会导致癌症的生长和进展。

这项研究发表在今天的《分子细胞》上，揭示了疾病进展的新机制，这可能导致新的研究方法，并最终导致更好的诊断测试和精确治疗。

虽然以前的研究集中在基因组编码蛋白的2%(即基因)，但这项研究分析了人类DNA巨大的非编码区中控制基因激活方式和时间的突变模式。

OICR研究人员、该研究的主要作者JriReimand博士说：“在这些大的非编码区，癌症驱动基因突变相对罕见，这些区域通常远离基因，这对系统数据分析构成了重大挑战。

“在新的统计工具和来自1800多名患者的全基因组测序数据的帮助下，我们发现了可能导致癌症和更具侵袭性的肿瘤的新分子机制的证据。”

研究小组分析了每个患者基因组的10万多个部分，重点关注经常被忽视的非编码区，这些区域通过三维基因组与基因相互作用。预测的30个关键区域中的一个在调控癌细胞中已知的抗肿瘤基因中起着重要作用，尽管它与基因组中的基因相距超过25万个碱基对。该团队在人类细胞系中进行了CRISPR-Cas9的基因组编辑和功能实验，以探索这一非编码区的癌症驱动特征。

Reimand说，“我们确定了几个可能与肿瘤发生有关的非编码区，但我们只是触及了表面。”“借助我们的算法和快速增长的患者癌症基因组和表观遗传谱数据集，我们期待实现未来的发现，这可能导致预测患者癌症进展的新方法，并最终找到患者疾病或诊断的新方法。更确切地说。"

Reimand的研究团队开发了这项研究背后的统计方法，并免费提供给研究小组。这些方法已经过世界各地的其他算法的严格测试。

“研究非编码基因组非常重要，因为这些巨大的区域调节我们的基因，并可以打开和关闭它们。这些区域的突变会导致这些调节开关功能异常，并可能导致或进展为癌症。”海伦说，的学生朱也是这项研究的第一作者。“我们已经证明，我们名为ActiveDriverWGS的方法可以挖掘这些区域，并找出对癌症生长至关重要的特定区域。”

“尽管这些候选驱动突变很罕见，但我们现在有了第一个实验证据，证明其中一个突变区域在人类细胞系中调节癌症基因和途径，”SickKids医院的研究助理、该研究的第一作者liisusukla-rei mand博士说。“随着研究界收集更多数据，我们计划更深入地研究这些领域，以了解这些突变如何改变特定癌症类型中的基因调控和染色质结构，从而为这些疾病的患者开发新的精确疗法。”

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