研究人员开发了一种新的抗菌化合物 重点是LsrK激酶的作用
芬兰东方大学的研究人员开发了新的抗菌化合物,重点是LsrK激酶的作用。LsrK激酶是一种参与细菌通讯的蛋白质。在ChemMedChem发表的一项新研究中,研究人员探索了LsrK激酶作为抗菌药物设计的目标。
在抗生素耐药性日益增加的时代,有必要重点开发新的抗菌药物。不断上升的耐药性警告我们遵循传统的抗生素药物开发机制。为了解决这一问题,整合联盟致力于验证可用于未来抗菌药物开发的新靶点。群体感应(QS)是一种细菌通讯过程,涉及宿主定殖、毒力因子产生、生物膜形成和感染建立。因此,研究干扰QS培养基生产和加工的群体淬灭和抑制剂已成为开发抗病毒药物的新策略。
QS是由称为自身诱导物(AI)的信号分子以群体密度依赖的方式介导的。AI-2信号分子来源于前体4,5-二羟基-2,3-戊二酮(DPD),参与种内和种间通讯。LsrK是一种参与AI-2分子磷酸化的激酶,其磷酸化形式的AI-2进一步调节QS途径。因此,抑制LsrK可以导致群体感应失活,干扰发病机制。
没有LsrK的抑制剂或蛋白质结构的报道(直到2018年)。因此,东芬兰大学的研究人员通过使用计算方法对LsrK的蛋白质结构进行建模,开始了药物设计工作。模拟的蛋白质结构用于筛选芬兰分子医学研究所提供的化合物库。赫尔辛基大学在LsrK抑制的实验测定中测试了优先命中。这项研究产生了两个主要的成功案例,并通过基于模拟的方法得到了进一步的证实。这种类似的方法导致了LsrK的微摩尔活性的四次点击。
这项研究鉴定的LsrK抑制剂是迄今为止报道的第一种LsrK抑制剂。这些hits将被进一步优化以获得高亲和力,并作为有用的工具来提高我们对抑制AI-2途径中LsrK的理解及其作为潜在抗病毒策略的重要性。考虑到对LsrK结构的有限了解,我们的研究提供了蛋白质行为的良好概述,并为更好地理解蛋白质-底物动力学以及如何干扰它提供了一个完美的起点。
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